基于公共数据库的单细胞测序分析和加权共表达网络分析发现,TNC是瘢痕疙瘩的新型生物标志物

时间:2023-11-27   信息来源:PUBMED

背景: 瘢痕疙瘩形成的病理生理学尚不清楚,因此识别瘢痕疙瘩的生物标志物可能是设计新的靶向疗法的一步,这将改善瘢痕疙瘩患者或有瘢痕疙瘩风险的患者的预后。

方法: 在这项研究中,我们基于公共数据库对瘢痕疙瘩进行了单细胞RNA测序分析、加权共表达网络分析和差异表达分析。并采用本中心瘢痕疙瘩患者的3个RNA测序数据进行验证。此外,我们对 16 例患者的瘢痕疙瘩组织和邻近正常组织进行了 QRT-PCR 以进一步验证。

结果: 我们确定了瘢痕疙瘩的敏感生物标志物:Tenascin-C(TNC)。然后,伪时间分析发现,随着成纤维细胞分化,TNC的表达水平先下降,然后稳定,最后升高,提示TNC可能在成纤维细胞分化中发挥潜在作用。此外,巨噬细胞M0浸润水平在TNC-高组和TNC-低组之间存在差异。巨噬细胞M0在低TNC-组中浸润水平较高(P<0.05)。

结论: 我们的研究结果可为瘢痕疙瘩的诊断和治疗提供新的思路。

参考文献:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35003102/